En FIA interesa promover innovaciones que generen valor para la empresa o industria y beneficios positivos para el sector o la sociedad en su conjunto. Para ello, cuenta con una diversificada cartera de instrumentos que persigue potenciar la competitividad de las empresas y productores nacionales y aportar así a la generación de valor, más empleos y mejor calidad de vida para los integrantes del sector.

Entre los instrumentos se cuentan los proyectos y estudios de innovación; los Programas de Innovación Territorial (PIT), los Consorcios Tecnológicos, los Programas de Desarrollo Tecnológico, giras tecnológicas  la realización de eventos técnicos, entre otros.

En el 2010, FIA administró una cartera de 235 iniciativas, considerando las que se iniciaron ese año y las de arrastre de períodos anteriores. Entre estas últimas se encuentran las correspondientes al Programa de Innovación en Marketing Agroalimentario (IMA), instrumento cuya última convocatoria se efectuó en 2009. Sus últimas iniciativas terminaron de ejecutarse en el 2010.

En recursos, la mayor parte de ellos se destinan a los 16 Programas de Innovación Territorial (PIT) en ejecución. Estos están integrados por distintos instrumentos, debidamente articulados, los cuales buscan solucionar un problema u oportunidad, mediante acciones innovadoras que coordinen a los diferentes actores de una cadena productiva. Se caracterizan por encontrarse circunscritos territorialmente.

En monto de recursos, les siguen los Consorcios Tecnológicos Empresariales y los Proyectos de Innovación.

Por rubros, el 80% de las iniciativas cofinanciadas por FIA, en porcentaje, se orientaron a los sectores agrícola y pecuario.

FIA realiza su acción a lo largo de todo el país, siendo las regiones Metropolitana, La Araucanía, Biobío y El Maule, donde se concentra el mayor número de iniciativas de la cartera vigente al año 2010.